{"id":6180,"date":"2025-11-25T08:42:25","date_gmt":"2025-11-25T08:42:25","guid":{"rendered":"https:\/\/campus.hesge.ch\/blog-master-is\/?p=6180"},"modified":"2025-11-25T08:42:26","modified_gmt":"2025-11-25T08:42:26","slug":"deposer-le-code-issu-de-la-recherche-quelles-pratiques-et-perspectives","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/campus.hesge.ch\/blog-master-is\/deposer-le-code-issu-de-la-recherche-quelles-pratiques-et-perspectives\/","title":{"rendered":"D\u00e9poser le code issu de la recherche\u00a0: quelles pratiques et perspectives\u00a0?"},"content":{"rendered":"\t\t
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Article \u00e9crit par<\/strong> La\u00ebtitia Reversy et J\u00e9romine Roth<\/p>\n

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Gestion du code et normes FAIR<\/em><\/p>\n

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L\u2019importance de la conservation des donn\u00e9es de mani\u00e8re p\u00e9renne<\/strong> et selon des normes FAIR<\/strong><\/a> n\u2019est plus \u00e0 d\u00e9montrer tant dans le domaine des sciences de l\u2019information que dans la recherche acad\u00e9mique[1]<\/a>. Toutefois la mise en pratique soul\u00e8ve encore de nombreux points d\u2019interrogation. La Suisse se positionne ainsi en faveur d\u2019une ouverture de la recherche, comme d\u00e9finie par les plans strat\u00e9giques pour l\u2019Open Research Data et l\u2019Open Access<\/strong>[2]<\/a>. Mais si la possibilit\u00e9 d\u2019acc\u00e9der \u00e0 un article en ligne est d\u00e9sormais dans les pratiques des chercheuses et chercheurs, d\u00e9poser les donn\u00e9es de la recherche ne va pas encore de soi<\/strong>. L\u2019exemple du code permet d\u2019observer plusieurs points de frictions dans la gestion des donn\u00e9es. En effet, un acc\u00e8s libre ne garantit pas une conservation de qualit\u00e9 ni le fait de pouvoir acc\u00e9der \u00e0 nouveau \u00e0 l\u2019objet recherch\u00e9[3]<\/a>.<\/p>\n

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En s\u2019appuyant sur les principes \u00e9rig\u00e9s par l\u2019UNESCO concernant l\u2019Open Science[4]<\/a>, les auteurs de l\u2019article \u00ab Source Code Archiving – to the Rescue of Reproducible Deployment \u00bb d\u00e9finissent la n\u00e9cessit\u00e9 de conserver le code<\/strong> produit dans la recherche :<\/p>\n

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Now that software is an integral part of scientific experimental workflows, it must be held to the same standards of other scientific workflows: computational workflows must be transparent and reproducible. While such a statement is becoming consensual among scholars, its implications are often less understood: source code must be publicly available, with a license that grants the right to use it, to study it, to modify it, and to share those modifications<\/em> (Court\u00e8s, Sample, Tournier et Zacchiroli, 2024[5]<\/a>).<\/p>\n

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Deux acteurs de la gestion et du partage du code<\/em><\/p>\n

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Diff\u00e9rentes plateformes existent pour d\u00e9poser du code telles que Zenodo<\/strong><\/a>. Cr\u00e9\u00e9e par le CERN, celle-ci fournit un identifiant p\u00e9renne, l\u2019indication de la licence et promet la garantie de la conservation des donn\u00e9es \u00e0 long terme, du fait du financement public du CERN et de sa mission scientifique au long court. Mais un rapide tour d\u2019horizon sur PubMed<\/strong>[6]<\/a> permet toutefois de constater que les programmeurs et programmeuses privil\u00e9gient les espaces de d\u00e9veloppement collaboratif comme Github<\/a>, qui offre diff\u00e9rents outils pour travailler sur du code dans diff\u00e9rentes versions (notamment Git), le partager et le documenter. De nombreux chercheurs et chercheuses qui d\u00e9posent des articles scientifiques sur Zenodo<\/a> uploadent ainsi leur donn\u00e9es logiciel sur GitHub. Les atouts de GitHub<\/strong> sont la standardisation et la visibilit\u00e9 imm\u00e9diate des \u00e9l\u00e9ments suivants :<\/p>\n

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